鳩山新政権の下で2700億円から1500億円に減額になった最先端研究開発支援プログラムなどの基金を設置する日本学術振興会（JSPS）は、今回の最先端プログラムの基金設置を1つのトライアルととらえている。「将来は、科学研究費補助金（科研費）も、基金で運用できるようにしたい。科研費の使い勝手が良くなり、大学などの事務負担を減らせる」と、2009年10月31日に日本生物物理学会第47回年会のサテライトミーティングとして徳島市で開催された「科研費制度を知る：とくに若手研究者に向けて」で、JSPSの宮嶌和男審議役は語った（関連記事1）。